國家科學及技術委員會新竹科學竹科管理局在竹科之事業專區用地已近飽和之狀況下，因竹南科學園區鄰近竹科且交通便捷，考量園區地幅之完整性，故選擇竹南科學園區作為竹科腹地之延伸。竹科管理局著眼於園區永續發展之遠景及落實環境保護工作，自民國八十七年園區開發時即已著手規劃設置雨、污水分流之下水道系統，竹南科學園區污水處理廠於民國九十二年開始啟用，妥善處理園區事業及研究單位廢污水。園區污水處理廠的設計最大處理容量為每日6萬噸，目前全區納管率達100%，實際每日處理污水量約2萬噸。園區內所產生的事業廢水及生活污水均經污水下水道收集匯入園區污水處理廠處理後，以優於國家放流水標準及環評承諾之水質（BOD₅平均值10.2 mg/L；COD平均值32.1 mg/L；SS平均值6.1 mg/L)，由專管放流。

竹科管理局，採以水量與水質為下水道使用費收費依據，並以分級累進加重及優惠折扣收費方式，鼓勵事業單位推動減量、減廢，以降低污染物排放量。於園區污水處理廠亦推動辦理放流水回收再利用及污泥再利用，均宣示竹科管理局對於「珍惜資源」的重視及執行成效。園區污水處理廠將秉持「持續改善」的精神，持續提昇放流水水質，與周邊社區建立和諧關係並貫徹環境政策之執行，以實踐「保護環境」、「珍惜資源」、「產業與環境生態永續生存」之經營理念，留給下一代一個清水放流的美樂之源。

國家科學及技術委員會新竹科學園區管理局